Jean Chassanion exerça d'abord dans l'Eglise pré-calviniste de Meaux, puis à Montauban et structura en 1560 l'Eglise protestante de Montpellier. Il desservit ensuite Troyes et Metz, lieux stratégiques pour la Réforme à cette époque, avant de se retirer à Genève d'où il publia son Histoire des Albigeois.